Tuesday, October 2, 2012

Metabolisme

Lihatlah @ku - Metabolisme merupakan aktivitas hidup yang selalu terjadi pada setiap sel hidup, padametabolism sel bahan dan energy diperoleh dari lingkungan sel yang berupa cairan.Cairan yang mengelilingi sel disebut cairan ekstrasel. Cairan ini terdiri dari ion dan gas berikut:

1. Gas (terutama o2 dan CO2)
2. Ion anorganik (terutama Na+, Cl- ,K , Ca++, HCO3, PO4).
3. Zat organic (makanan dan vitamin )
4. HormoneMekanisme pertukaran zat dalam sel dengan cairan eksternal melalui lima cara, yaitudifusi, osmosis, transport aktif, endositosis, dan eksositosis.

Bahan yang terdapat dalam cairan sel dapat digunakan sebagai bahan baku gula, asamlemak, gliserol dan asam aminoyang kemudian disusun menjadi makromolekul sel seperti polisakarida, lipid dan protein asam nukleat.

Metabolism dapat dogolongkan menjadi dua, yaitu anabolisme dan proses pembongkaranyang disebut katabolisme.

A. Enzim
Beberapa reaksi kimia dalam tubuh mahluk hidup terjadi sangat cepat. Hal ini terjadikarena adanya suatu zat yang membantu proses tersebut. Bila zat ini tidak ada ada maka proses – proses tersebut akan terjadi lambat atau tidak berlangsung sama sekali. Zattersebut dikenal dengan nama fermen atau enzim.
Enzim adalah bio katalisator , yang artinya dapat mempercepat reaksi – reaksi biologitanpa mengalami perubahan struktur kimia.Menurut kuhne (1878) , enzim berasal dari kata in + zyme yang berarti sesuatudidalam ragi.Berdasarkan penelitian maka dapat disimpulkan bahwa enzim adalah suatu protein yang berupa molekul – molekul besar, yang berat molekulnya adalah ribuan. 
Sebagai contoh adalah enzim katalase berat molekulnya 248.000 sedang enzim urese beratnya adalah 438.000.Pada enzim terdapat bagian protein yang tidak tahan panas yaitu disebut denganapoenzim, sedangkan bagian yang bukan protein adalah bagian yang aktif dan diberinama gugus prostetik, biasanya berupa logam seperti besi, tembaga , seng atau suatu bahan senyawa organic yang mengandung logam. 
Apoenzim dan gugus prostetik merupakan suatu kesatuan yang disebut holoenzim, tetapiada juga bagian enzim yang apoenzim dan gugus prospetiknya tidak menyatu. Bagiangugus prostetik yang lepas kita sebut koenzim, yang aktif seperti halnya gugus prostetik.Contoh koenzim adalah vitamin atau bagian vitamin (misalnya : vitamin B1, B2, B6,niasin dan biotin).
 
1. Cara kerja enzim Ada dua cara kerja enzim , yautu model kunci gembok dan induksi pas.
 
a. Model kunci gembok (block and key)
Enzim dimisalkan sebagai gembok karena memiliki sebuah bagian kecil yang dapat berikatan dengan substrat . bagian tersebut disebut sisi aktif.Substrat dimisalkan sebagai kunci karena dapat berikatan secara pas dengan sisi aktif enzim (gembok).
b. Induksi pas (model induced fit)
Pada model ini sisi aktif enzim dapat berubah bentuk sesuai dengan bentuk substratnya. 
2. Factor – factor yang mempengaruhi kerja enzim 
a. Temperatur 
Karena enzim tersusun dari protein, maka enzim sangat peka terhadap temperature.Temperature yang terlalu tinggi dapat menyebabkan denaturasi protein. Temperature yangterlalu rendah dapat menghambat reaksi. Pada umumnya temperatur optimum enzimadalah 30 – 400C.Kebanyakan enzim tidak menunjukkan reaksi jika suhu turun sampai 00c , namun enzimtidak rusak, bila suhu normal maka enzim akan aktif kembali . enzim tahan pada suhurendah, namun rusak diatas suhu 500c. 
b. Prubahan pH 
Enzim juga sangat terpengaruh oleh pH. Perubahan pH dapat mempengaruhi perubahan asam amino kunci pada sisi aktif enzim sehingga menghalangi sisi aktif  berkombinasi dengan substratnya. pH optimum yang diperlukan berbeda – bedatergantung jenis enzimnya.

c. Konsentrasi enzim dan substratAgar reaksi berjalan optimum, maka perbandingan jumlah antara enzim dan zubstratharus sesuai. Jika enzim terlalu sedikit dan substrat terlalu banyak reaksi akan berjalanlambat bahkan ada substrat yang tidak terkatalisasi . semakin banyak enzim, reaksi akansemakin cepat.
3. Inhibitor Enzim 
Seringkali enzim dihambat leh suatu zat yang disebut inhibitor, ada dua jenisinhibitor yaitu sebagai berikut:
a. Inhibitor kompetitif.
Pada penghambatan ini zat – zat penghambat mempunyai struktur yang mirip denganstruktur substrat. Dengan demikian baik substrat maupun zat penghambat berkompetisiatau bersaing untuk bersatu dengan sisi aktif enzim , jka zat penghambat lebih dulu berikatan dengan sisi aktif enzim , maka substratnya tidak dapat lagi berikatan dengansisi aktif enzim. 
b. Inhibitor nonkompetitif 
 Pada penghambatan ini, substrat sudah tidak dapat berikatan dengan kompleks enzim-inhibitor, karena sisi aktif enzim berubah.
 

4. Nomenklatur dan klasifikasi enzim
Enzim diberi nama dengan menambahkan akhiran ase terhadap nama substrat yangdiubah oleh enzim tersebut, misalnya enzim maltase menjadi glukosa; enzim yangmengubah lemak (lipid) adalah lipase; enzim – enzim yang mengadakan perubahankarbohidrat merupakan kelompok karbohidrase.Berdasarkan peristiwa – peristiwa yang terjadi didalam suatu reaksimaka enzim dapat digolongkan menjadi golongan berikut:

a. Golongan Hidrolase,yaitu enzim yang dengan penambahan air atau dengan adanya air dapat mengubahsuatu substrat menjadi hasil akhir, misalnya karboksilase, protese dan lipase. 
b. Golongan Desmolase,yaitu enzim yang dapat memecah ikatan C – C atau C – N , contohnya enzim – enzim peroksidase, dehidrogenase, katalase, karboksilase dan transaminase
Dengan berkembangnya ilmu generika dan dilakukannya berbagai percobaan di bidangini, dapat dibuktikan bahwa pembentukan enzim atau kelompok enzim diatur oleh genatau keompok gen dalam kromosom. George beadle dan Edward tatum mendapat hadiahnobel pada tahun 1958 dalam menemukan gen – gen pengandali sintesis protein danenzim, yang disimpulkan dalam suatu teori “one gene one enzyme”.
 
Sifat – sifat Enzim : 
1) Sebagai bio katalisator :
- mempengaruhi kecepatan reaksi kimia, tanpa ia sendiri mengalami perubahan kimiayang bersifat permanen.- jumlah tidak perlu banyak 
2) Bersifat spesifik 
, artinya suatu enzim hanya aktif pada substrat tertentu.
3) Dipengaruhi suhu :
- suhu maksimum- suhu optimum ±400C- suhu minimum
4) dipengaruhi pH ,
suatu ezim hanya aktif pada pH tertentu saja
5) dapat diluar dan didalam sel.
 
C. FOTOSINTESIS

Suatu ciri hidup yang hanya dimiliki oleh tumbuhan hijau adalah kemampuan dalammengggunakan zat karbon dari udara untuk diubah menjadi bahan organic sertadiasimilasi dalam tubuh tumbuhan. Oleh karena proses pengubahan itu memerlukanenergy cahaya, maka asimilasi zat karbon disebut fotosintesis. Atau secara lengkap pengertian fotosintesis atau asimilasi karbon ialah proses pengubahan zat – zat anorganik H2O dan CO2 oleh klorofil menjadi zat organic karbohidrat dengan bantuan cahaya.Peristiwa fotosintesis dapat dinyatakan dengan persamaan reaksi kimia sebagai berikut: 

6CO2+6H2O --(cahaya/klorofil)--> C6H12O6+6O2

Kloroplas sebagai bahan dasar fotosintesis memiliki energi dari sinar mataharidisimpan lalu diubah menjadi molekul dan glukosa. Didalam mitokondria energy yangtelah diubah menjadi glukosa dibongkar kembali untuk digunakan bagi keperluan proses – proses dalam sel.

Kloroplas dibungkus oleh dua lapisan (membrane) , lapisan dalam berupa suatumembrane yang kompleks , pada membrane ini terdapat beberapa lapisan kantung yangrata , disebut grana. Zat warna klorofil dan molekul – molekul yang membantu penangkapan sinar matahari berada sisalam grana.didalam seluruh grana terdapat larutan protein yang disebut stroma. 

TAHAPAN – TAHAPAN FOTOSINTESIS 

Proses fotosintesis yang terjadi di kloroplas melalui dua tahap reaksi, yaitu reaksi terang dan reaksi gelap.

1. Reaksi terang 
Terjadi bila terdapat sinar, misalkan sinar matahari. Selama tahap ini klorofildidalam membrane gana menyerap sinar merah dan nila yang bergelombang panjang pada spectrum sinar.Energy yang ditangkap oleh klorofil digunakan untuk memecah molekul air. Pemecahanini disebut fotolisis. Fotolisis mengakibatkan molekul air pecah menjadi hydrogen danoksigen. Reaksi fotolisis dapat ditulis dengan persamaan:
 
2 H2O 2 H2+ O2H2 yang terlepas ditampung oleh koenzim NADP.  Dalam hal ini, NADP bertindak sebagai akseptor H2, bentuknya berubah menjadi NADPH2 dan O2 tetap dalam keadaan bebas. NADP (Nikotinamida Adenin Dinukleotida Fosfat) merupakan koenzim yang penting peranannya dalam kegiatan oksidasi reduksi dan banyak terdapat dalam sel hidup. Selama proses tersebut dihasilkan ATP.

2. Reaksi gelap
Blackman (1905)
adalah seorang ahli membuktikan bahwa reduksi dari CO2 ke CHO berlangsung tanpa sinar. Sehingga reaksi gelap disebut pula sebagai reaksi blackman atau reduksi CO.Bila reaksi terang (Hill) dan reaksi gelap (blackman) digabung maka reaksinya sebagai berikut:
Hill: 2 H2O 2 NADPH2 + O2
Balckman: CO2 + 2 NADP H2 + O2 2 NADP + H2 + CO + O + H2 + O2
Penggabungan : 2 H2O + CO CH2O + H2O + O2
 
 
Bila baris terakhir ini dikalikan 6 , maka kita akan memperoleh:
12 H2O + 6 CO2 (CH2O)6 + 6 H2 + 6 O2

B. Andrew dan Melvin Calvin (1950)
dari universitas kalifornia mengemukakanfiksasi CO2pada proses foto sintesis / asimilasi C. siklus asimilasi C dalam organismfotoautotrof dapat digambarkan sbb:
 
Reaksi gelap merupakan penyusutan CO2 oleh H2 yang dibawa oleh NADP tersebut.Dalam peristiwa ini , penyusutan CO2 tidak membutuhkan sinar , sehingga reaksi tersebutdinamakan reaksi gelap.D. KEMOSINTESISPeristiwa asimilasi dengan zat kimia sebagai sumber energinya disebut sebagaikemosintesis,organism pelakunya disebut sebagai organisme kemosintetik ataukemoautotrof.Organisme kemoautotrof ini juga menggunakan CO2 sebagai sumber karbonnya,akan tetapi energy untuk melakukan proses asimilasi berasal dari energy kimia , bukandari cahaya.Energy diperoleh dari hasil oksidasi senyawa anorganik yang diperoleh darilingkungannya , missal : sulfide, nitrogen , sulfur, besi, ammonia, nitrit.
Organisme pelaku kemosintesis : 
a. Bakteri Belerang, missal : Beggiatoa, Thiotrix.
b. Bakteri nitrifikasi, missal : Nitrosomonas,Nitrosococcus, Nitrobacter.
c. Bakteri besi,      
   missal ferrobacillus.
 
"bakteri nitrifikasi banyak ditemukan di buntilakar tumbuhan kacang - kacangan"Jadi kemosintesis menggunakan bahan anorganik sebagai sumber energinya dan CO2sebagai sumber karbon dan air.Untu lebih jelas lihat bagan persamaan dibawah ini :
Senyawa anorganik + O2 ------- E + hasil sampingH2O -------- H2 + O2CO2 + H2 -------- glukosa
B. RESPIRASI  SEL
Didalam setiap sel hidup terjadi proses metabolism. Salah satu proses tersbutadalah katabolisme. Katabolisme disebut pula disimilasi, karena dalam proses ini energyyang tersimpan ditimbulkan kembali atau dibongkar untuk menyelenggarakan proses –  proses kehidupan .Respirasi sel berlangsung didalam mitokondria melalui proses glikolisis, yakni proses pengubahan atom C6 menjadi C3. Dilanjutkan dengan proses dekarboksilasioksidatif yang mengubah senyawa C3 menjadi senyawa C2 dan C1 (CO2). Kemudiandaur krebs mengubah senyawa C2 menjadi senyawa C1(CO2¬).Pada setiap tingkatan ini dihasilkan energy berupa ATP (adenosine Tri Phosphat) danHidrogen . hydrogen yang berenergi bergabung dengan akseptor hydrogen untuk dibawake transfer electron ; energynya dilepaskan dan hydrogen diterima oleh O2 menjadi H2O.Didalam proses respirasi dihasilkan senyawa antara CO2 yang merupakan bahandasarproses anabolisme.Didalam proses respirasi sel bahan bakarnya adalah gula heksosa. Pembakaran tersebutmemerlukan oksigen bebas, sehingga reaksi keseluruhan dapat ditukis sebagai berikut :
C6h12O6 + 6 CO2 ---------------- 6 CO2 + 6H2O + 675 kal
Dalam respirasi aerob. Gula heksosa mengalami pembongkaran dengan prosesyang sangat panjang. Pertamakali glukosa sebagai bahan dasar mengalami fosfolarisasi,yaitu proses penambahan fosfat kepada molekul – molekul glukosa hingga menjadifruktosa -1, 6 – difosfat. Pada fosforilasi , ATP dan ADP memgang peranan pentingsebagai pengisi fosfat.Adapun pengubahan fruktosa – 1 , 6 – dipospat hingga akhirnya menjadi CO2 dan H2Odapat dibagi menjadi empat tahap , yaitu glikolisis, reaksi antara (dekarboksilasioksidatif), siklus krebs, dan transfer electron. 
1. Glikolisis
Adalah rangkaian reaksi pengubahan molekul glukosa menjadi asam piruvat denganmenghasilkan NADH dan ATP.
Sifat – sifat glikolisis ialah:a. Dapat berlangsung secara aerob maupun anaerob b. Dalam glikolisis terdapat kegiatan enzimatis dan AdenosineTrifosfat (ATP) sertaAdenosine Difosfat (ADP)c. ADP dan ATP berperan dalam pemindahan fosfat dari molekul satu ke molekul lainnya.Glukosa sebagai substrat dalam respirasi aerob (maupun anaerob) diperoleh dari hasilfotosintesis.diawali dengan penambahan satu fosfat oleh ATPO terhadap glukosa,sehingga terbentuk glukosa – 6 fosfat dan ATP menyusut menjadi ADP . peristiwa ini
disebut fosfolirasi yang berlangsung dengan bantuan enzim heksokinase dan ion Mg++hasil akhir dari fosfolirasi berupa fruktosa-1, 6-difosfat dan dari sinilah dimulai glikolisis.
Glikolisis dimulai dari perubahan fruktosa -1, 6-difosfat yang memiliki 6 buah atom Cdiubah menjadi 3-difosfogliseral-dehida (dengan 3 buah atom C) dan dihidroksi-aseton-fosfat. Pembongkaran ini dibantu oleh enzim aldolase.Dihidroksi aseton fosfat kemudian menjadi 3- fosfogliseraldehida juga dengan pertolongan enzim fosfitriosaisomerase. 
Selanjutnya fosfogliseraldehida bersebyawa dengan suatu asam fosfat (H3PO4) dan berubah menjadi 1,3 –disfosfogliseraldehida. 
1,3 – difosfogliseraldehida berubah menjadi asam 1,3 –difosfogliserat dengan bantuanenzimdehidrogenase. Peristiwa ini terjadi karena adanya penambahan H2.Dengan bantuan enzim transfosforilase fosfogliserat serta ion – ion Mg++, asam 1,3-difosfogliserat kehilangan satu fosfat sehingga berubah menjadi asam – 3 – fosfogliserat. 
Selanjutnya asam – 3 – fosfogliserat menjadi asam – 2 – fosfogliserat karena pengaruhenzim fosfogliseromutase.Dengan pertolongan enzim enolase dan ion – ion Mg
++, maka asam- 2-fosfofogliseratmelepaskan H2O dan menjadi asam -2-fosfoenolpiruvat.Perubahan terakhir dalam glikolisisadalah pelepasan satu fosfat dari asam-2-fosfoenolpiruvat menjadi asam piruvat. Enzim transfosforilase fosfopiruvat dan ion – ionMg++ membantu proses ini sedang ADP meningkat menjadi ATP.
2. Reaksi Antara
Setelah glikolisis terjadi reaksi antara. (dekarboksilasi oksidatif), yaitu pengubahanasam piruvat menjadi 2 asetil KoA sambil menghasilkan CO2 dan 2NADH2yang reaksinya adalah :
2 NAD 2NADH22(C3H4O3) 2 (C3H3O) – KoA + 2CO2
Piruvat Asetil KoA
Perubahan asam piruvat menjadi asetil KoA merupakan persimpangan jalanuntuk menuju berbagai biosintesis yang lain. Asetil KoA yang terbentuk kemudianmemasuki siklus krebs.
3. Siklus Krebs ( Siklus Asam Sitrat)
Pada siklus krebs ini (terjadi dimatriks mitokondria) asetil KoA diubah menjadi KoA.Asetil KoA bergabung dengan asam oksaloasetat membentuk asam sitrat. KoA dilepaskansehingga memungkinkan untuk mengambil fragmen 2C lain dari asam piruvat.

Pembentukan asam sitrat terjadi diawal siklus krebs , sementara itu sisa dua karbon dariglukosa dilepaskan sebagai CO2.Selama terjadi pembentukan – pembentukan , energy yang dibutuhkan dilepaskan untuk menggabungkan fosfat denga ADP membentuk molekul ATP.Pada siklus krebs , pemecahan rantai karbon pada glukosa selesai, Jadi, sebagai hasildari glikoslisis , reaksi antara dan siklus krebs adalah pemecahan satu molekul glukosa 6karbon menjadi 6 molekul 1 karbon, selain itu juga dihasilkan 2 molekul ATP dariglikolisis dan 2 ATP lagi dari siklus krebs.Perlu diingat bahwa tiap – tiap proses melepaskan atom hydrogen yang ditranspor kesistem transport electron oleh molekul pembawa .
4. Sistem transport electronPada sistem transpor electron berlangsung pengepakan energy dari glukosa menjadiATP.
 
Reaksi ini terjadi didalam membaran dalam mitokondria, hydrogen dari siklus krebs yangtergabung dalam FADH2 dan NADH diubah menjadi elektorn dan proton.Pada sistem transport electron ini, oksigen adalah akseptor electron yang terakhir , setelahmenerima electron , O2 akan bereaksi dengan H+ membentuk H2O. pada sistem ini                dihasilkan 34 ATP.

5. Respirasi Aerob dan Anaerob 
 
a. Respirasi aerob
adalah suatu proses pernapasan yang membutuhkan iksigen dariudara.Ada beberapa tumbuhan yang kegiatan respirasinya menurun bila konsentrasi oksigen diudara dibawah normal, misalnya bayam, wortel dan bebrapa tumbuhan lainnya.
b. Respirasi anaerob
dapat pula disebut fermentasi atau respirasi intramolekul. Tujuanfermentasi sama dengan respirasi aerob, yaitu mendapatkan energy. Hanya saja energiyang dihasilkan jauh lebih sedikit dari respirasi aerob.
Pernapasan anaerob dapat berlangsung didalam udara bebas, tetapi proses ini tidak menggunakan O2 yang disediakan di udara. Fermentasi sering pula disebut sebagai peragian alcohol atau alkoholisasi.Pada respirasi aerob maupun anaerob, asam piruvat hasil proses glikolisis merupakan substrat.


Saat ini agan sedang membaca artikel di blog Lihatlah @ku. Semoga artikel yang agan baca ini dapat bermanfaat. Jangan lupa BERKOMENTAR dengan baik di blog ini ya? :)

No comments:

Post a Comment

Berkomentarlah dengan baik dan benar. Karena jika ada komentar yang mengandung SPAM, akan segera dihilangkan. Terima kasih :)